Om met een eendenkooi eenden te mogen vangen is het allereerst noodzakelijk dat er Kooirecht op een eendenkooi rust. Dit is het recht om op een bepaalde plek een eendenkooi te mogen hebben en ook als zodanig te gebruiken.
Hiervoor is het noodzakelijk dat een eendenkooi geregistreerd is. Een eendenkooi wordt om de 5 jaar opnieuw geregistreerd waarvoor dan een bewijs van registratie wordt afgegeven dat 5 jaar geldig is. Om de eendenkooi te registreren dient deze aan een de zogenaamde minimale wettelijk eisen te voldoen.
Deze eisen zijn omschreven in de wet en houden concreet in:

• Er moet een vangbare pijp op de kooi aanwezig zijn
• Deze vangbare pijp staat in directe verbinding met een open wateroppervlak van tenminste 200 m2
• In dit wateroppervlak moet een cirkel beschreven kunnen worden met een straal van 7,5 m
• Het water moet minimaal 50 cm. diep zijn
• Rondom het water ligt een rand van bos of struweel.

Alleen geregistreerde eendenkooien kunnen opnieuw geregistreerd worden, er kunnen thans geen nieuwe kooien geregistreerd worden. In de wet is ook bepaald dat bij de registratie naam en adres vermeld worden van de houders van een kooikersakte die volgens opgave van de eigenaar als kooikers zullen optreden.
Op deze wijze is het aantal eendenkooien in Nederland aan banden gelegd. Op dit moment worden met het ministerie van LNV gesprekken gevoerd om op enkele plekken oude kooien weer op te nemen in de registratie. Tot op heden is nog niet duidelijk wat de mogelijkheden daartoe zullen worden.